學校分別于2004年3月和2008年9月啟動校訓和校徽的修訂工作，經廣泛征集、反復論證、認真修訂，并經過2009年1月16日第四屆教代會暨第九屆工代會審議，通過了新的校訓和校徽的定稿方案。

新的校訓為：“誠 樸 勤 仁”，原校訓“團結 勤奮 求實 創新”改作校風使用。 新的校徽是在原校徽的基礎上修改而成，原校徽不再使用。

校訓“誠樸勤仁”，分別從我校前身中央大學校訓“誠樸雄偉”和金陵大學校訓“誠真勤仁”中各取二字組合而成，是我校在百余年辦學歷程中，秉承中央大學、金陵大學優良傳統，逐步形成的具有南農特色的精神品格。